2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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9 Q, h8 x' o5 N3 P# W7 |7 R0 o% q 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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4 w1 D6 I. N3 f# N 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。! ]: ~3 S8 i/ ?5 K# L
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。% Y- l' U1 w6 n: Z5 n3 {- D
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。. r6 |1 n* O" l T+ ^
6 _6 l+ S# D$ ^+ g! O* q4 _ 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。2 D# S0 t: z# m7 c* O8 u
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。7 \; r" q' }& P) j/ E, q
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature
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Nature Cell Biology$ i3 X6 f+ }' ~9 `
9 R' k0 ~1 z7 R Nature Chemistry
5 C" {, Y" X4 B3 S% B" u/ c2 _" _. b0 A0 ~1 v! j3 g5 |
Nature Chemical Biology
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Nature Climate Change8 M3 L3 S8 Y% b, d1 D( [8 w
8 [1 K' Y. f9 q
Nature Communications
5 I: i" j9 M% A5 J& n; h# V' z; Z& p& q8 s: B5 O0 l
Nature Genetics
7 P6 C8 M+ E @/ X, h: i
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6 c* E" x1 `$ F! ?4 O7 w) ] Nature Immunology, d/ f3 {9 o. c2 w
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Nature Medicine
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Nature Materials
Q. \. L& @. f3 `# p1 a) i2 o. O/ ]
Nature Methods
7 G) B# G( z& r9 H" ^" A E8 R
- _; v' w& f6 H+ H0 `2 q Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology, r5 _4 @% E; T8 D0 G w' `
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! Z: H8 _/ C/ t
' @; R' `1 u; V0 y. s Nature Physics
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
' _5 r# U, ]8 h# L7 z3 X0 g9 ?
/ ` U& G6 d, y3 p1 f; f# a NI依据的68本期刊如下：
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7 v L( y0 @/ \; q/ m Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry/ B) M d+ ]8 Q8 v. o
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Angewandte Chemie International Edition! u* e5 q' n% {2 d o! @. _0 p7 a$ z
2 m$ [/ ^- S, ^7 ]
Applied Physics Letters
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Astronomy & Astrophysics
% b: n: x V5 v2 N2 e$ t' D6 s6 ]& _* v/ `4 X, K
Cancer Cell
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Cell（《细胞》）/ ~4 ~% [, x: J8 S
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Cell Host & Microbe5 b( x+ ?; K) d3 M7 H2 H' X
1 a2 P8 w3 v9 P; g5 [
Cell Metabolism |7 Q( G* Y3 _4 k' j1 R( g5 u- {* }
8 C7 o7 N8 H8 T! |1 o
Cell Stem Cell
8 k9 A. [& g Z" N7 q0 X% H6 ^/ j h, d4 \" p1 X
Chemical Communications
& j( ~; Z9 B `. M
0 Q8 n0 O8 }' e! s4 x5 R8 Z u Chemical Science
& c, ~5 j3 A, l9 e6 H" y# ^' {% g2 i$ y' l+ B
Current Biology
7 N& C/ G8 o0 j+ @: t6 @8 D* D4 y! h% q7 a. ?( R* T: N2 `
Developmental Cell' @3 ^1 _; D' T5 k8 }
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Earth and Planetary Science Letters& H$ w5 l7 \2 N/ S9 ]+ \! Q
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Ecology Letters
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7 f7 [* S$ r$ ^9 p. s& G! v/ j. |& k European Physical Journal C7 @5 T, ~$ k% {1 s% _ ~7 W
9 P: X6 u6 P+ X) ]1 ]6 c Genes & Development
2 [0 H/ x* N# o! x, A$ H' b+ D+ B6 l6 }5 A* X0 E/ C7 T
Genome Research
6 F( R2 }9 g* E5 J! p8 s0 r" {* g+ ^# O8 L. `
Geology. c- i- V1 O. H1 N+ V$ K' p# C" d
6 Q4 O5 p7 A& I, G
Immunity
) k3 C( x# @$ v" p0 r, U! Y
! [7 [" h% k) H8 _ F( N Inorganic Chemistry8 s$ d( f! }: {: {% D- R5 }' f. n
& N, X8 G K$ U Journal of Biological Chemistry
4 j# h v4 ^9 e, O4 S1 w8 P8 K
% Q# r l; z& @; Z D Journal of Cell Biology( R" }; W8 r$ I. ?) t0 R
1 w. }" ]2 B" S( Z$ u Journal of Clinical Investigation/ H; B6 e& T2 J5 ]
$ {6 H0 X8 @# n. B x) w" Y Journal of Geophysical Research: Atmospheres. i4 P* e- l' f$ b* d
5 f. g7 [/ o5 o+ ~; y% i Journal of Geophysical Research: Oceans
_) S6 t, l, M- }6 E1 ~: f0 h. s
Journal of Geophysical Research: Solid Earth
" I7 I" z6 t' E. v$ l, c& V: d
! J7 x- f# q8 d Journal of High Energy Physics. d1 `& Y' e1 Y5 ~6 H
+ @& D. X+ L. y/ A6 g6 O
Journal of Neuroscience
& X' S- P3 B m
$ W" n% ~9 n7 P* x* T+ Q Journal of the American Chemical Society2 N5 j- N/ o# K! [5 w; Z
! b) ]" [6 O, P5 [! Q" g
Molecular Cell8 q5 a1 @" D+ o8 g- E" c1 ~
+ |/ @6 D1 W( b& ? Monthly Notices of the Royal Astronomical Society: U8 {- c1 x) B( i
' R3 e! s' Y. m& i1 i
Nano Letters5 c5 w0 @) i/ b
& p6 @& L8 e# y6 c1 Z
Nature （《自然》）
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Nature Biotechnology- W) a& j. M2 f9 u! v& m* c
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/ p: z0 p4 ~! }
Nature Communications( h0 Z+ s# N C- V5 `) D- h
3 ? H; N. \6 w0 H' M Nature Genetics
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Nature Geoscience
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7 X2 f$ ?2 S% ?5 h- V2 A Nature Materials
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5 s# r4 q3 B2 k% ^" u Nature Medicine1 r7 O# ^" v" |. O8 o: G! L
# e% ~1 C2 U% e Nature Methods; L9 O* i2 w7 N
. Z4 i0 h- w" r- y7 u Nature Nanotechnology0 J1 @& `" j* t
, k1 F. ?* D, u& F
Nature Neuroscience" l! V% _; u5 e- S3 p$ l" s
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Nature Physics
, z, C# j7 F5 l1 F' ^0 x! [' S) C; H* ]& U% j% N
Nature Structural & Molecular Biology
9 }+ X9 ~' |7 Y! V l0 j5 g; q0 r
% N+ o- L' h: L* ? l1 y Neuron% i2 X2 D' |( h! i3 v" H6 S
+ ~& ]9 X3 z6 O! _) a/ W. C Organic Letters c0 Z! T/ _/ j! y* }5 }+ Y
, A: N2 D* _+ r) M PLOS Biology
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' E9 ?' @; W/ _/ K+ S! g; g$ q Physical Review B
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Physical Review D5 G& B4 H1 D" y0 H" Y) P* Z
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Physical Review Letters
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2 E# b, |( i$ y
Proceedings of the Royal Society B( Z( h6 C8 |& K
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" [9 |% u- [8 Y7 i( y The Journal of Physical Chemistry Letters- J+ q1 }/ q( }, o8 A& K
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