2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。) ^7 n O3 X2 U& S( \
2 o9 x r" S/ p3 y Z 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。) i5 W: C% [+ y* [2 E* x
- L8 J7 k. y' c) M1 I. {' d
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。* @* \5 l6 H S0 \; J2 g1 A2 t
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。* Q/ k' x7 L8 J
: k' c& ^. `/ S f6 A { 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。1 d {# p( u1 @1 [
9 g" p% q4 i& H5 r1 x “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature# O; X( P& ^5 D3 x
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Nature Biotechnology
3 U F" W1 p' o; d& z4 B' E* a! S, J% a0 K
Nature Cell Biology
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Nature Chemistry
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Nature Chemical Biology/ |$ O# C7 U) L& M/ D) h* A
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Nature Communications3 Z' C: F" Z* @* j9 V( v
3 u. o+ h6 L& C/ i9 ]2 _- O
Nature Genetics
: u: _; A2 s" A; R
, }! b8 Q1 H; H2 q6 S! }+ z Nature Geoscience
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Nature Immunology
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! G! b; `/ H! l1 z0 {& t# J Nature Medicine3 |0 t& Q0 v4 Y; d% o$ \: q
* _+ ~7 ?5 v( X4 _ Nature Materials
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Nature Methods7 x- q4 q7 u* l0 [; N6 b
/ ^' S; [2 `9 J; W6 i% `
Nature Neuroscience
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- j* G- L0 i8 v Nature Nanotechnology
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Nature Photonics
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: h+ S4 s; W o A$ E( u Nature Physics
: V" M2 p1 z# F7 \& B6 N S; r* J
- \' b2 F; [0 q D( g2 [0 H Nature Structural & Molecular Biology+ \* Y0 s& Q4 Z
& |& D' i# y7 O4 O5 b$ i 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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- G: N; L; l7 I1 v: n NI依据的68本期刊如下：* e- \# d, M' g+ d
0 G) W: K! B' h7 g, W
Advanced Materials
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7 r) q- j: \: m American Journal of Human Genetics
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' a% u% H8 h6 f Angewandte Chemie International Edition, `2 l: x, @$ w
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6 r/ S. c1 j* H7 z" v$ B( g& F Astronomy & Astrophysics
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7 N: S8 x7 \8 w0 o( _# ]) F Cell（《细胞》）
4 G3 R, l4 R* C
7 Q0 S# p% H( R- h3 m! ^ Cell Host & Microbe, Z# }# ?( W$ @
3 [ u. A' ]& \/ C) f/ n( l! J
Cell Metabolism1 q" c1 K0 `1 r0 y4 ^' P5 `
" F/ L. n! b* A Cell Stem Cell
% @! P3 c0 Q4 V, l' T* l: t( T
- K. ]( A- Q2 C5 Y | Chemical Communications
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Chemical Science. f& M$ a) ?# k+ B
" [4 d. b* U1 T! T& P
Current Biology& E: T2 \) J9 s
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Ecology0 r" t6 y- [' j: \
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Ecology Letters; U9 e- A$ A/ \* k- m* s5 e7 D
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( u# i) U6 A6 J: N5 r. s9 D! M# L8 t) t7 B
Genes & Development; o) C7 T' {! U2 h% u+ ]; Y
4 Z3 Q. w! o# {# M Genome Research4 x% y0 s2 {4 A3 \+ {
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Geology
" K p9 L8 Z7 `& S0 m% H8 f& X/ i; I
Immunity9 {& a6 j9 R- Z Q8 P
* B2 H1 V7 w, r0 F8 E0 p( w Inorganic Chemistry
/ }! G! h0 T& Q- e# c/ H
( T+ e# h; Z6 V; k4 K Journal of Biological Chemistry
9 k8 v# F' _* [# P$ x; H3 Y9 w: B" Y& J/ f# F
Journal of Cell Biology
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5 C( L5 w/ z* q1 U+ [- y6 D/ q( C+ o Journal of Clinical Investigation% w! I# E9 M7 d! D4 d5 g
# }& b& m9 e$ m3 y6 l+ y) O; D Journal of Geophysical Research: Atmospheres- v5 g8 G3 H+ ^
! S2 P$ J, W" b- J' A
Journal of Geophysical Research: Oceans
. ~' o' A3 N$ ~; Y' J
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; G' ?0 {* B" C
Journal of High Energy Physics
% g" } S( d% K$ ]/ d/ L
+ i2 K k3 J6 n8 w& m Journal of Neuroscience T4 a; |0 l7 c. u
4 C7 V/ C9 q9 A0 a; L e
Journal of the American Chemical Society
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) s( G9 T7 w2 ]+ m& {' i; H Molecular Cell: q0 W: N# v" m0 \# p6 b
" C( J S* e% I1 l7 \( ?
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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! x0 B5 Y) e" r" M7 I Nano Letters
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Nature （《自然》）; F+ i) {4 t; ~
: e% v" b! g4 X" B4 ^: Q7 x Nature Biotechnology
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8 F2 h- V1 Y% h6 b' C( [1 A) \5 ~5 y Nature Cell Biology- \( c o( h9 O: c d
6 X5 N+ k8 x! {8 R% m* \% D
Nature Chemical Biology
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Nature Chemistry
& h9 A( x6 r7 F: d, p- A' d
4 l- {4 o0 t+ B* W- n8 s5 A Nature Communications
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' |2 W' {1 f" a4 ^ Nature Genetics3 [" s/ j! ^# d0 T# q' G$ ~
3 F o' F- C9 }7 e5 L3 D( x( u Nature Geoscience
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Nature Immunology) ~, r/ m% c. p, b- p
% U- _( n. ~1 x' f4 A Nature Materials4 Q$ d' o1 L5 p3 i9 w8 I
4 }/ v) e% L) n) z6 q2 k
Nature Medicine
) t' f2 C; v7 i( y1 o) ^. V- ?& v- l. A: Z4 n- P
Nature Methods4 d# S7 H5 M) r4 b1 Z; I
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Nature Nanotechnology+ b/ v& z, ~" G( u0 r" Y
# M- m8 B+ }' T/ q; I Nature Neuroscience5 u1 t$ x0 a3 J p
7 A: j4 }0 g* `% ~ Nature Photonics" h4 t E( O4 n. {; i3 V
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Nature Physics
% z4 ^3 y/ H3 l; B/ S+ u0 D# p9 Z) Q2 P
Nature Structural & Molecular Biology
. b1 x8 p5 C! O c6 c5 z- e+ M. ^- w% K" f* ?6 |* _
Neuron3 U7 i2 i1 F- {! o
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The Astrophysical Journal Letters
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The EMBO Journal- }7 R/ V- K- s S( X( T% J( Z
5 G1 y3 }5 ~- L9 C1 r* T
The Journal of Physical Chemistry Letters Q: T* c/ v, Z/ R
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