2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。+ ]! W2 `4 z4 |# e' X' k) V
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。8 K/ J; r( A) g9 \
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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! s, `( Y0 Z7 s$ U9 `+ ~$ C 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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( f# Y; j6 E/ W 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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6 X2 G" U6 P7 J' s+ t+ O6 b# i6 O' X+ U NPI依据的18本期刊如下：
3 q8 Y/ p) |% f, U) z
& n5 V/ b4 B* U Nature
- U7 @) z8 L1 o: V, @' M/ I/ }6 U8 z) ^4 L% o) V9 x
Nature Biotechnology( M( r' v; h2 S! V
" B' @, u4 ~ e" X( L; a5 x4 S7 G Nature Cell Biology* h. i3 x& M( ?7 f% i
1 f4 D% M, @6 t$ q/ d7 g1 D Nature Chemistry& }$ ]8 s1 P* F3 j( G) {4 i
9 C$ [9 a7 f4 h0 g" k. g N) r: c& q
Nature Chemical Biology$ l+ }3 y( [ W* n1 ]
0 _3 `0 j5 M. m! p. c e Nature Climate Change
9 P5 |( O0 p0 y* Q( e8 A6 F& |/ [( B6 _+ k$ t/ S
Nature Communications3 d- I v5 P# p3 s w
8 F) w2 t" Z! P Nature Genetics5 Z( A5 M* s& x9 z+ e
# a2 f9 s9 L" {; d/ w# W" j+ j# d Nature Geoscience6 M2 t( k' z. h; T. \$ d" j
4 R: R5 ^# ~' k: N2 M Nature Immunology* I4 u% P* J- n' k' M8 S/ T$ V
, u# T# S2 }$ V4 S, R# \, t% X2 I Nature Medicine
2 p$ e$ o0 k) _" m M
" l$ N/ Y o( I9 ?4 c" Y R5 Q' i Nature Materials$ k0 C. l9 v- H! Z! L) m% G
8 S7 k) M) \) w. P0 o Nature Methods
9 o; v: v& ]. r# }3 G: E/ M& ]2 N- ]' Y: Z
Nature Neuroscience0 ~& G% o% \, O# x1 `
5 _+ z6 z) K3 i8 A. g
Nature Nanotechnology
0 P- J% R6 n, M: W
6 B8 x. ?: G( |' r- { L0 h P Nature Photonics+ T0 P, Y# }+ n `( r
9 E) k, B+ @0 \& X7 ?6 R* Z Nature Physics+ |- T; k& r! }# V
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Nature Structural & Molecular Biology
6 {( u8 l) T0 h: P* |4 b
; Y% k* \2 a. U6 m/ V; _( z+ \ 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。$ j# I: a" h$ x2 A( @! Q' C
3 M5 w# D" s& B& Z5 U! g2 I NI依据的68本期刊如下：6 \( @: ?3 h: N3 f
4 s5 f5 r5 z; A
Advanced Materials
2 x& v% W+ q* s2 Z; h+ Q3 U; ]/ P
9 g9 S! ^- D/ b- { American Journal of Human Genetics
# k0 U6 Y3 {/ x d6 g1 O3 ~" m
. ^, \9 s1 a% a4 Z& ^6 n; A; { Analytical Chemistry! ~) K8 x, O- ?2 [. f
0 U6 a8 n9 C, q' {& j Angewandte Chemie International Edition
. }7 X3 N3 h- ^/ Q! }, |& @4 y! _9 @! O5 M
Applied Physics Letters
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Astronomy & Astrophysics
3 n4 v9 f2 N: G# i2 p+ H& E/ ]
6 _& t$ o+ k8 i8 \; ^ Cancer Cell
# M K& t5 A: M; {) p6 \. J( T, Z; V$ K
Cell（《细胞》）. [2 j2 u1 V# \
' f4 t1 m+ Q0 `) f* _* t1 \
Cell Host & Microbe
' c8 t/ P2 M# ^4 p( ~7 V4 o2 c; p! L; F1 D* A
Cell Metabolism2 k4 j& y0 c# o+ z. e' D9 Z) q3 {
% Z E) K1 k$ y: A5 j
Cell Stem Cell6 C5 A9 E- G! X
# ?. `; w$ q" N' g Chemical Communications
# V p, F& M1 X7 r
3 g4 t e$ p$ ^: n! G Chemical Science& \" D; y" k6 Z" P, p
4 N2 S, {6 G" G e3 C: v' o6 ^ Current Biology
4 x# X% R: s h/ {2 p; n- w5 a$ _- U8 }. w* ~
Developmental Cell
9 D% D5 O) F( K3 v, q7 G0 c8 D
3 X9 F* R4 s' U Earth and Planetary Science Letters' v+ n+ ?& F3 U/ n
' @$ D# y0 \9 d9 B0 p( Y' z; [. F Ecology% {- g, P) z! b7 @/ J% ?# v
( G- Y& E j) n1 x( z7 h& D Ecology Letters
0 M* ~9 L; B. I7 ?0 G9 U5 b
* i% z, k& e% _3 q European Physical Journal C+ [3 O+ v4 b" A
. K U0 q" }! Z8 c2 M
Genes & Development2 t8 w. ?1 T8 g
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Geology
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2 s% j! o% a! T- q0 ?
7 a/ \- e& S2 s- r2 [& ?! Q& C Inorganic Chemistry
) U3 ^" ^9 {; L8 Y5 f% w) ?' g o: z& U, ^. }/ h' u5 v5 o% ~( O) b
Journal of Biological Chemistry
" Q5 v+ \5 y" F9 }5 }4 `0 r8 Q1 G$ ~$ Z$ m
Journal of Cell Biology
/ g% |7 Q$ `" R* b7 l- I
, g2 u1 S& V6 s9 i8 u! f Journal of Clinical Investigation# `) N0 T& h# B* q: L: R+ h
1 V7 r) l6 }# I+ n
Journal of Geophysical Research: Atmospheres
* w n6 o7 G9 [+ S5 r! z& c! ?
: F7 l+ H3 X* d8 W7 a7 f Journal of Geophysical Research: Oceans
! c/ O+ H8 |) w3 L( {
9 D: [) ?3 u) @4 I& F Journal of Geophysical Research: Solid Earth1 [& V: b! }; ~; q
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# H# ~- I: f* f5 C Journal of the American Chemical Society
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w$ ?, [ A5 l" H; }# } Nature （《自然》）
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. y% O/ y. O9 U0 Y, w, U) V" v" w Nature Biotechnology$ U- n( `& c: r8 _! c
. C$ K4 O% z/ A: w( g& C- L/ b6 O
Nature Cell Biology5 w. j, A* x3 C. b+ s! Q& g% g
; D4 ]( C+ m' u5 }: {5 K
Nature Chemical Biology: X, p3 m! c# m: p Z" q
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1 S, y; y. {* E0 X4 X0 e Nature Genetics& f% l4 j% E7 F; k7 \/ g/ D
4 g b2 f4 n2 h0 r7 R$ ?! w; Y Nature Geoscience
! o6 M! [& P! X/ C, u) k/ Q4 I0 d* L9 v. G1 [9 V% {$ c- L6 b) N
Nature Immunology
9 U& m5 n/ n6 e0 p1 R+ o4 k
6 t1 X" k) b2 }2 y/ @3 A Nature Materials: i& L6 Z, K8 r3 X( C' N
+ h g. a' z$ P8 ]* F Nature Medicine% g4 N* h7 p0 P: f0 E
; b a/ R2 z/ e0 q6 O b
Nature Methods
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% E) B, F6 U0 j- \( G: I Nature Nanotechnology
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9 t; V- z5 e6 a N- j y$ ` Neuron
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