2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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$ o- g" U f! M; Y% t9 v* y 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。8 _+ t( a& f1 l5 X x4 B3 E3 y
0 n# Z) I, Y) j9 L# R
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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- H, g# M3 N' a: Y; P$ B- ~1 V+ I 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。* r, O3 N; r# {1 d
, R# {1 G9 |4 z 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。% o* k- S5 K O7 G
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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( Q0 c& e# N# ^2 A$ p! y: ~1 h NPI依据的18本期刊如下：2 Z" y8 ]& M) d+ `; f
) u0 t& ?) H; W2 A Nature
# V1 Z: v7 J$ ^! v y0 Q8 S8 F2 b
Nature Biotechnology
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2 \/ v$ p( q; Y% [8 k! @ Nature Cell Biology
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Nature Climate Change! k- A4 R2 N, a. G2 U+ X0 X
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/ G+ C3 j6 Z0 i; }9 M! e
Nature Genetics
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& M- c" F7 o7 Q4 c! m0 I Nature Geoscience
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Nature Immunology/ c! q8 P4 M# F# P. M+ H8 W
# [0 n4 v1 r( U# ^2 l ~7 D
Nature Medicine
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$ u5 U6 D' u! n Nature Materials
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Nature Methods. y& y5 {& |8 c7 s4 [+ y3 G7 x+ g1 }
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Nature Neuroscience
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1 D. L: b f( g Nature Nanotechnology' k. n6 ]7 O4 M2 E
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3 r6 L8 i3 r" |; W
9 P# O" P- G: k. ^) n* _8 } Nature Physics
0 O. K3 J* T+ c# g) n: E% ?3 D: k
Nature Structural & Molecular Biology
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) @: L! A' |2 s( e 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。, M& m' B/ @, w; c
: Z- E. r3 K1 T, M" ]' B! ~
NI依据的68本期刊如下：
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American Journal of Human Genetics& L( f, T4 O9 a+ L5 G6 u. c+ L
# P# r: R! ]7 G
Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition
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Applied Physics Letters9 ~+ y1 y+ L( v2 N
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Astronomy & Astrophysics" n" a1 T: R( p% U8 r! \$ K7 L0 p; K( Q
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Cancer Cell
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( P, l$ Q& S2 |, D Cell Stem Cell
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Chemical Communications' A2 c: S0 K1 h8 B" d
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Chemical Science' c( ?2 M) C) ^+ b- |# U
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Current Biology5 i' Z% Q/ ]) |( ]7 ? G [9 P8 _
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+ N4 R! f, M/ t* g. ]4 }- o
Earth and Planetary Science Letters: u: w; W6 g) s3 J9 l
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Ecology7 I% Y* G8 ?9 Q. A
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European Physical Journal C4 o5 r! e2 [4 D8 B% g6 l2 p. r. c
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5 E- u# @% y% |" f9 p
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Immunity
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Inorganic Chemistry6 d* o! t; Y4 Y9 k" M% ^2 G
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Journal of Biological Chemistry
( F# E* _8 b5 ]% w* B! j5 E
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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Journal of Geophysical Research: Oceans* c# y ?( b" V: S
2 w2 [" U- w; e( A7 v7 T. D5 @ Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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Nature （《自然》）
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Nature Cell Biology o9 o* m; K6 ]( j
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Nature Immunology
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Nature Neuroscience/ i# S0 S. o$ f! a }9 e$ O) v
9 @8 A8 Y% z8 W$ I: S Nature Photonics
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Nature Structural & Molecular Biology
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Neuron4 i$ s6 c& k" m \
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The Journal of Physical Chemistry Letters
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